2006年，广州市国家税务局组织税收收入1069.05亿元，比上年增长18.59%，增收167.55亿元。其中，组织国内税收收入（计划考核口径）781.52亿元，比上年增长23.71%，增收149.8亿元。中央、省、市三级税收收入同步协调增长。中央级税收收入883.37亿元，比上年增长18%；省级税收收入60.36亿元，增长23.76%；市县级收入125.32亿元，增长20.34%。是年，该局税收首次突破1000亿元大关，在全国15个副省级城市中，广州率先跨入年国税收入规模超千亿元的城市行列，成为继上海、北京后全国第三个年国税收入规模超千亿元的城市。